「月の桜が枯れると世界は崩壊してしまうんです。」
突如として世界中のありとあらゆるものが次々と魔法に置き換わってしまうようになった世界で主人公の晋也は「ミリア」と名乗る一人の少女と出会う。
その少女によるとこの現象は月の桜の力の暴走によるものでこのままいくと力を使い果たしてしまうらしい。
そしてその原因となる人物は主人公の身近な人間であるという。
両親が不在の主人公にとって身近な人間と言えば幼馴染の「月ヶ瀬」しかいない。
「世界を救うためにはあなた自身でその原因を見つけないといけません。」
ミリアのサポートを受けながら晋也はこの現象の原因について探っていくのであった......